Vezető: Dr. Garay Tamás
Tagok: Blonski Lara, Dévényi Vanda, Dobos Nikolett, Merényi András, Oláh Hanna, Pittner Dávid, Szabó Luca
Kapcsolat: garay.tamas@itk.ppke.hu
A Transzlációs Onkológiai Laboratóriumot a Semmelweis Egyetem Belgyógyászati és Onkológiai Klinikája, valamint a Pázmány Péter Katolikus Egyetem Információs Technológiai és Bionikai Kara közösen alapította. Ennek megfelelően a Laboratóriumnak egyedülálló lehetősége nyílik arra, hogy a napi klinikai rutinban felmerülő kérdéseket mind az orvosbiológiai, mind a mérnöki megközelítések kompetenciáival vizsgálja (bench-to-bed). Hasonlóképpen, a tudományos eredmények könnyen átültethetők a klinikumba, kiindulópontként szolgálva új terápiás megközelítésekhez (bed-to-bench).
A laboratóriumban végzett kutatásokhoz egy jólfelszerelt, átfogó sejttenyésztő laboratórium áll rendelkezésünkre; célunk, hogy szövettani daganatmintákban vagy folyadékbiopsziákban (liquid biopsy) olyan új terápiás célpontokat, prognosztikai és prediktív markereket (nukleinsavakat, fehérjéket, extracelluláris vezikulákat) azonosítsunk, amelyek kulcsfontosságúak lehetnek a daganatos folyamatok megértésében. A potenciális célmolekulák aktiválásának és gátlásának hatásait tumorsejt-modelleken teszteljük. Kiemelt figyelmet fordítunk a daganatsejtek migrációs aktivitásának változására, mivel a sejtvándorlás elengedhetetlen folyamat az áttétek kialakulása során.
Divergens kezelési válaszok a különböző migrációs paraméterek függvényében. Az elmozdulás-alapú (displacement-related) és az útvonal-alapú (path-related) paraméterek log2 transzformált, normalizált értékei az egyes sejtvonal–kezelés kombinációkban. Minden egyes pont az egyedi kezelési választ mutatja a kontrollhoz normalizálva. A szürke pontok a konkordáns paraméterváltozásokat jelzik. A piros pontok a növekvő elmozdulást mutatják csökkenő útvonal-alapú mutatók mellett, míg a narancssárga pontok a csökkenő elmozdulást jelzik növekvő útvonal-alapú mutatók mellett. A függőleges és vízszintes vonalak a változatlanságot jelölik (log2 = 0). Jobb oldali panel: a diszkordáns (eltérő irányú) válaszok aránya, az összes értékelt körülmény százalékában kifejezve. A színek megegyeznek a pontdiagramokon használtakkal. Az elmozdulás-alapú pontszám (displacement-based score) az átlagos négyzetes elmozdulás (MSD), az elmozdulás (D) és a maximális elmozdulás (Max D) átlagértéke. Az útvonal-alapú pontszám (path-based score) a teljes megtett távolság (TTD), a sebesség (V) és az átlagsebesség (AV) átlagértéke.
Jövőbeli kutatási irányok, együttműködési lehetőségek
Együttműködések során leginkább sejtes modellekkel (migrációs, proliferációs, inváziós mérések), klinikai minták és adatok elemzésével valamint statisztikai vizsgálatokkal tudjuk a közös célt szolgálni.
